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CESOAR

早稲田大学​空間オミックス解析研究拠点

​利用の流れ

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アカデミアの方

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コンサルティング

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​最適なアプローチを提案

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局所領域遺伝子発現解析

局所領域遺伝子発現解析
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微小組織採取装置を使用し、
微小組織切片の採取・回収を行う。
採取した切片においてRNA-seqを行うことも可能。
Chromium (scRNA-seq)
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ハイスループットなシングルセル解析が可能。
細胞の集団および状態に関する詳細な解析が可能。

Chromium
(scRNA-seq)

Chromium
(scRNA-seq)

Xenium

Xenium
Xenium
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サブセルラーの解像度の
遺伝子発現空間解析が可能。
複雑な組織、近傍領域、
細胞間相互作用を理解し、
他の空間的オミックス、組織、
形態に関する情報と
の統合解析が可能。

蛍光物質のついたプローブをハイブリダイズさせ、
Xenium Analyzer​で蛍光を画像ベースで測定します。

新鮮凍結切片またはFFPEサンプルに対応

Phenocycler

組織微小環境における
空間的シングルセル解析システム

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凍結切片、FFPE切片を用いて
50色以上のタンパク質の蛍光免疫染色が可能。
シングルセルの解像度でイメージングが可能。

Phenocycler

PacBio Revio
(ロングリードシーケンス)

Visium

Visium
Visium

サブセルラーの解像度の遺伝子発現空間解析が可能。
複雑な組織、近傍領域、細胞間相互作用を理解し、
他の空間的オミックス、組織、形態に関する
情報との統合解析が可能。

蛍光物質のついたプローブをハイブリダイズさせ、Xenium Analyzer​で蛍光を画像ベースで測定。

新鮮凍結切片またはFFPEサンプルに対応。

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PacBio Revio (ロングリードシーケンス)

Revio システムを用いた
HiFi シークエンシングにより、
数万塩基のHiFiリードを取得。
卓越したシーケンス精度であり、
DNA のメチル化の直接検出や
配列中のコンテクストを問わず

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均一なカバレッジのリードを取得可能。
エピジェネティックな解析やリピート配列の解析や
アイソフォーム解析が可能である。加えて、
ターゲットシークエンシングが可能。

PacBio Revio
(ロングリードシーケンス)

PacBio Revio
(ロングリードシーケンス)

インフォマティクス解析

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​結果報告

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CESOAR / BINDSインシリコ統合ユニットでできること

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局所領域遺伝子発現解析
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10xGenomics Visium
​空間遺伝子発現解析
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10xGenomics Chromium
シングルセル遺伝子発現解析
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PacBio Revio
ロングリードシーケンシング
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10xGenomics Xenium
​空間遺伝子発現解析
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AKOYA​ Phenocycler
タンパク質蛍光免疫染色
*メニューにないものは、ご相談ください

​お知らせ​

2026年2月12日

BINDS発現・機能解析インシリコ解析融合ユニットオンライン・シンポジウムのご案内

【日時】
2026年2月19日(木)15時〜16時50分
【概要】
本シンポジウムでは、2024年夏から本格稼働した早稲田大学空間オミックス解析研究拠点CESOARが生み出している、新しい生命科学像の一端をご紹介いたします。CESOARでは、BINDSの枠組みのもと数多くの研究支援を実施しており、多くのデータ測定とデータ解析が進んでいます。その中で様々な結果が得られるとともに、様々なノウハウが蓄積され始めており、今後も研究を支援しながら、従来の生命科学研究では見えなかった地平線の向こう側に踏み込んでいきます。今回はCESOARを活用する方法ご案内するとともに、CESOARの支援により研究が進展した3つの案件をご紹介いたします。
【内容】
15:00 - 15:05 はじめに
由良 敬(早稲田大学理工学術院・教授)
15:05 - 15:20 CESOARにおける研究支援の紹介
松永 浩子(早稲田大学ナノ・ライフ創新研究機構・研究院准教授)、
竹山 春子(早稲田大学理工学術院・教授)
15:20 - 15:50 空間オミクス解析に基づく婦人科癌の分子病態解と次世代治療戦略
良元 大介(東京大学医学部産婦人科学教室・大学院生)
15:50 - 16:20 単一細胞RNAシークエンスによる内皮細胞の臓器特異的加齢性変化の解析と今後の展開
高野 晴子 (日本医科大学先端医学研究所病態解析学部門・教授)
16:20 - 16:40空間オミクスを用いた慢性腎臓病の病態解明 (ビデオ講演)
菊池 寛昭(東京科学大学病院 血液浄化療法部・助教)
16:40 - 16:50 閉会挨拶
由良 敬
【場所】
オンライン(ZOOM)
以下のウェブサイトよりお申し込みください。登録時に参加URLが送信されます。
https://forms.office.com/r/wagWbiNfZW

2025年7月1日

CESOARとBINDSの講演会・シンポジウムを開催します。

CESOARとBINDS発現・機能解析・インシリコ解析連携ユニットによる講演会とシンポジウムの開催が決定しました。

2025年10月3日(金) 午後:オンライン講習会
当該ユニットの支援を受けた研究チームによる発表と、ユニットメンバーによるデータ解析フローの紹介を通して、オールインワン解析の全体像を講習します。

2025年11月21日(金) 午後:オンサイト講習会
オンライン講習会に参加された方と当該ユニットの研究支援を受けている方の中から、データのインシリコ解析を自らの手でやってみたい方に、早稲田大学の講習室でPCを使いながらデータ解析の講習をおこないます(人数定員あり)。

2026年2月19日(木):オンラインシンポジウム
当該ユニットに設置された空間オミックス解析研究拠点CESOARからの成果を中心に、ユニットの連携から生まれた様々な成果をご紹介します。

※日程と申し込み方法の詳細は、後日お知らせいたします。

2024年12月9日

CESOARが早稲田大学研究活動ニュースにて紹介されました。

早稲田大学の研究活動ニュースにおける「研究設備・機器の共用で加速する科学技術のイノベーション」にて、竹山春子教授及び空間オミックス解析研究拠点CESOARが紹介されました。

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早稲田大学空間オミックス解析研究拠点
Center for Spatial Omics Analysis Rearch (CESOAR)

東京都 新宿区 早稲田 鶴巻町 513 121号館

CESOAR-support[at]list.waseda.jp

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