CESOAR
Waseda University Research Center for Spatial Omics Analysis
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consulting
We propose the optimal approach.
Xenium
Xenium
Xenium
Subcellular resolution gene expression spatial analysis is possible.
Complex organizations, neighboring regions,
Understanding intercellular interactions,
Other spatial omics, organizations,
Integrated analysis of morphological information is possible.
The probes coated with fluorescent substances are hybridized,
Fluorescence is measured using an image-based method with Xenium Analyzer.
Suitable for fresh frozen sections or FFPE samples.
Visium
Visium
Visium
Subcellular resolution gene expression spatial analysis is possible.
To understand complex tissues, neighboring regions, and intercellular interactions,
Integrated analysis with other spatial omics, tissue, and morphological information is possible.
A probe coated with a fluorescent substance is hybridized, and the fluorescence is measured image-based using a Xenium Analyzer.
Suitable for fresh frozen sections or FFPE samples.
PacBio Revio (long-read sequencing)
Revio System
HiFi sequencing allows
Tens of thousands of base pairs of HiFi reads were obtained.
With outstanding sequencing accuracy,
Direct detection of DNA methylation, regardless of the context within the sequence.
Reads with consistent coverage can be obtained.
Epigenetic analysis, repeat sequence analysis, and isoform analysis are possible. In addition,
Target sequencing is possible.
PacBio Revio
(Long read sequence)
PacBio Revio
(Long read sequence)
Informatics analysis
Results report
What you can do with the CESOAR / BINDS In Silico Integration Unit
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notice
May 15, 2026
BINDS発現・機能解析インシリコ解析融合ユニットオンライン講習会のご案内
【日時】2026年6月5日（金）15時〜17時5分
【概要】
本講習会では、当該融合ユニットでどのような研究支援がなされてきたかを具体的に支援申請者から紹介してい ただきます。これから当該融合ユニットでのCESOARオミックス解析研究支援を検討されている方々にとって参考になる内容です。また、当該融合ユニットの特徴であるオールインワン解析において、どのようなインシリコ解析が行われているのかを、実演も交えてご紹介いたします。インシリコ解析をご自分でも実施されたい研究者の方々は、ぜひとも参加いただき、7月10日（金）に開催いたしますオンサイト・インシリコ講習会に参加申込ください。
【内容】
15:00-15:10 開会とCESOAR紹介
竹山 春子（早稲田大学理工学術院・教授）、
松永 浩子（早稲田大学ナノ・ライフ創新研究機構・研究院准教授）
15:10-15:40 支援申請者からの研究紹介1
「活性化好中球におけるリン脂質動態の解明と生理的意義」
宇留野 武人（九州大学生体防御医学研究所 研究推進ユニット・准教授）
15:40-16:10 支援申請者からの研究紹介2
「mRNAプロセシングを介した遺伝子発現制御機構解明におけるタンパク質構造モデリングからのアプローチ」
拓植 知彦（京都大学化学研究所 生体分子情報研究領域・准教授）
16:10-16:35 インシリコ解析講習会1（昨年度と同内容）
「実験系研究者のための Nextflow を用いたRNA-seq解析実践」
井内 仁志（早稲田大学理工学術院総合研究所・研究院講師）
16:35-17:00 インシリコ解析講習会2
「RNAseq解析の結果からタンパク質の立体構造予測を試みるには？」
由良 敬（早稲田大学理工学術院・教授）
17:00-17:05 閉会挨拶
由良 敬
【場所】
オンライン（ＺＯＯＭ）
以下のウェブサイトよりお申し込みください。登録時に参加URLが送信されます。
https://forms.cloud.microsoft/r/zfUBQmijU5
February 12, 2026
BINDS発現・機能解析インシリコ解析融合ユニットオンライン・シンポジウムのご案内
【日時】
2026年2月19日（木）15時〜16時50分
【概要】
本シンポジウムでは、2024年夏から本格稼働した早稲田大学空間オミックス解析研究拠点CESOARが生み出している、新しい生命科学像の一端をご紹介いたします。CESOARでは、BINDSの枠組みのもと数多くの研究支援を実施しており、多くのデータ測定とデータ解析が進んでいます。その中で様々な結果が得られるとともに、様々なノウハウが蓄積され始めており、今後も研究を支援しながら、従来の生命科学研究では見えなかった地平線の向こう側に踏み込んでいきます。今回はCESOARを活用する方法ご案内するとともに、CESOARの支援により研究が進展した３つの案件をご紹介いたします。
【内容】
15:00 - 15:05 はじめに
由良 敬（早稲田大学理工学術院・教授）
15:05 - 15:20 CESOARにおける研究支援の紹介
松永 浩子（早稲田大学ナノ・ライフ創新研究機構・研究院准教授）、
竹山 春子（早稲田大学理工学術院・教授）
15:20 - 15:50 空間オミクス解析に基づく婦人科癌の分子病態解と次世代治療戦略
良元 大介（東京大学医学部産婦人科学教室・大学院生）
15:50 - 16:20 単一細胞RNAシークエンスによる内皮細胞の臓器特異的加齢性変化の解析と今後の展開
高野 晴子 （日本医科大学先端医学研究所病態解析学部門・教授）
16:20 - 16:40空間オミクスを用いた慢性腎臓病の病態解明 （ビデオ講演）
菊池 寛昭（東京科学大学病院 血液浄化療法部・助教）
16:40 - 16:50 閉会挨拶
由良 敬
【場所】
オンライン（ＺＯＯＭ）
以下のウェブサイトよりお申し込みください。登録時に参加URLが送信されます。
https://forms.office.com/r/wagWbiNfZW
July 1, 2025
CESOARとBINDSの講演会・シンポジウムを開催します。
CESOARとBINDS発現・機能解析・インシリコ解析連携ユニットによる講演会とシンポジウムの開催が決定しました。
2025年10月3日(金) 午後：オンライン講習会
当該ユニットの支援を受けた研究チームによる発表と、ユニットメンバーによるデータ解析フローの紹介を通して、オールインワン解析の全体像を講習します。
2025年11月21日(金) 午後：オンサイト講習会
オンライン講習会に参加された方と当該ユニットの研究支援を受けている方の中から、データのインシリコ解析を自らの手でやってみたい方に、早稲田大学の講習室でPCを使いながらデータ解析の講習をおこないます（人数定員あり）。
2026年2月19日(木)：オンラインシンポジウム
当該ユニットに設置された空間オミックス解析研究拠点CESOARからの成果を中心に、ユニットの連携から生まれた様々な成果をご紹介します。
※日程と申し込み方法の詳細は、後日お知らせいたします。
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